نام کتاب: Scalable Big Data Analytics For Protein Bioinformatics – Efficient Computational Solutions For Protein Structures
نویسنده: Dariusz Mrozek
ویرایش: ۱
سال انتشار: ۲۰۱۸
کد ISBN کتاب: ۳۳۱۹۹۸۸۳۸۷, ۹۷۸۳۳۱۹۹۸۸۳۸۲
فرمت: PDF
تعداد صفحه: ۳۱۵
انتشارات: Springer
Description About Book Scalable Big Data Analytics For Protein Bioinformatics – Efficient Computational Solutions For Protein Structures From Amazon
This book presents a focus on proteins and their structures. The text describes various scalable solutions for protein structure similarity searching, carried out at main representation levels and for prediction of 3D structures of proteins. Emphasis is placed on techniques that can be used to accelerate similarity searches and protein structure modeling processes.
The content of the book is divided into four parts. The first part provides background information on proteins and their representation levels, including a formal model of a 3D protein structure used in computational processes, and a brief overview of the technologies used in the solutions presented in the book. The second part of the book discusses Cloud services that are utilized in the development of scalable and reliable cloud applications for 3D protein structure similarity searching and protein structure prediction. The third part of the book shows the utilization of scalable Big Data computational frameworks, like Hadoop and Spark, in massive 3D protein structure alignments and identification of intrinsically disordered regions in protein structures. The fourth part of the book focuses on finding 3D protein structure similarities, accelerated with the use of GPUs and the use of multithreading and relational databases for efficient approximate searching on protein secondary structures.
The book introduces advanced techniques and computational architectures that benefit from recent achievements in the field of computing and parallelism. Recent developments in computer science have allowed algorithms previously considered too time-consuming to now be efficiently used for applications in bioinformatics and the life sciences. Given its depth of coverage, the book will be of interest to researchers and software developers working in the fields of structural bioinformatics and biomedical databases.
درباره کتاب Scalable Big Data Analytics For Protein Bioinformatics – Efficient Computational Solutions For Protein Structures ترجمه شده از گوگل
این کتاب ارائه تمرکز بر پروتئین و ساختار آنها. متن توصیف راه حل های مختلف مقیاس پذیر برای جستجوی ساختار پروتئین شباهت، در سطوح نمایندگی های اصلی و برای پیش بینی سازه ۳D پروتئین انجام شده است. تاکید بر تکنیک های است که می تواند مورد استفاده قرار گیرد برای سرعت بخشیدن به جستجو شباهت و فرآیندهای مدل سازی ساختار پروتئین قرار داده است.
محتوای این کتاب به چهار بخش تقسیم شده است. بخش اول اطلاعات در زمینه پروتئین و سطح نمایندگی خود، از جمله یک مدل رسمی یک ساختار پروتئین ۳D مورد استفاده در پردازش های محاسباتی و خلاصه ای از فن آوری های مورد استفاده در راه حل ارائه شده در کتاب فراهم می کند. بخش دوم از کتاب مورد بحث خدمات ابر که در توسعه برنامه های کاربردی ابر مقیاس پذیر و قابل اعتماد برای ساختار پروتئین ۳D جستجوی تشابه و پیش بینی ساختار پروتئین استفاده شده است. بخش سوم از کتاب نشان می دهد استفاده از مقیاس پذیر چارچوب محاسباتی بزرگ داده، مانند Hadoop و جرقه، در صف عظیم ۳D ساختار پروتئین و شناسایی مناطق ذاتا بی نظم در ساختار پروتئین است. بخش چهارم از کتاب در پیدا کردن شباهت ها ۳D ساختار پروتئین، شتاب با استفاده از GPU ها و استفاده از چند رشته و پایگاه داده های رابطه برای جستجوی تقریبی کارآمد در ساختار دوم پروتئین متمرکز است.
کتاب تکنیک های پیشرفته و ساختار های محاسباتی از دستاوردهای اخیر در زمینه محاسبات و موازی معرفی که به نفع. پیشرفت های اخیر در علوم کامپیوتر الگوریتم قبلا هم زمان مصرف به حال به صورت بهینه برای برنامه های کاربردی در بیوانفورماتیک و علوم زندگی استفاده می شود در نظر گرفته اجازه داده اند. با توجه به عمق آن از پوشش، این کتاب مورد توجه پژوهشگران و توسعه دهندگان نرم افزار مشغول به کار در زمینه های بیوانفورماتیک ساختاری و پایگاه داده پزشکی باشد.
[box type=”info”]
جهت دسترسی به توضیحات این کتاب در Amazon اینجا کلیک کنید.
در صورت خراب بودن لینک کتاب، در قسمت نظرات همین مطلب گزارش دهید.